Hacia el mes de julio del año 1986 un grupo de amigos de la Urb. Las Magnolias y alrededores decidieron participar en el fútbol amateur de las ligas distritales, para lo cual fundaron el CLUB DEPORTIVO LAS MAGNOLIAS, que participo en la tercera división de la Liga Distrital de Barranco con relativo éxito, a pesar de los continuos ataques tanto físicos como verbales que sufrían los miembros del plantel cuando íbamos arriba en el marcador, situaciones que se fueron dando sistemáticamente durante las temporadas 86, 87 y 88 truncando así el ascenso del club a la segunda y primera división de la liga de Barranco respectivamente.
Ante esta adversa situación se decide dejar de participar en la liga de Barranco y mudar el club a la liga de San Isidro, para lo cual se tuvo que cambiar el nombre de la institución, ya que no se podía utilizar el nombre con el que se participaba en la liga de Barranco; así nace un 5 de septiembre de 1989 el CLUB DEPORTIVO APREMASUR.
Ese mismo año se disputo el torneo de segunda división en la liga de San Isidro, con relativo éxito, quedando siempre entre los primeros puestos, escapándose el título de nuestras manos en definiciones de infarto, donde lamentablemente la suerte y el gol no estuvieron de nuestro lado, así fue durante las campañas 90 y 91, donde se hizo un buen papel, hasta que en la campaña 92 la suerte y los goles estuvieron de nuestro lado en una campaña impecable donde nada ni nadie pudo impedir el alzarnos con el titulo para ascender a primera división y disputar el campeonato de esa categoría en el siguiente año (1993), de esta primera etapa como APREMASUR, salio de nuestro plantel Alexis Ubillús quien jugo en Defensor Lima, Universitario de Deportes, Sporting Cristal, Municipal, Melgar, Alianza Lima, Deportivo Universidad San Martín de Porres entre otros; y vistió la blanquirroja en varias ocasiones para disputar eliminatorias, así como en la Copa América.
En 1993 asciende a Primera división de Liga donde comparte la categoría en ese año con instituciones como: Universidad Católica del Perú, Club San Roberto, Farmacia San Juan, Textiles Unión, entre otros; teniendo en este primer año relativo éxito haciendo un buen papel, logrando una respetable campaña en su año de debut.
En 1994 se crean las divisiones inferiores del Club con la categoría 80, disputando campeonatos de prestigio y de buen nivel como son: el campeonato provincial y departamental de Lima y La Copa Crema 2000. En el 95 se obtuvo el titulo de la Copa Provincial de Lima, en los siguientes años se logro el sub-campeonato de la Copa Departamental de Lima, tercer puesto en la primera edición de la Copa Crema 2000, donde participaron equipos del prestigio de Universitario de Deportes, Sipesa, Cantolao, entre otros esta categoría siempre estuvo dentro de los primeros 4 puestos en los campeonatos en los que participo, de este plantel también participa Carlos Orejuela quien jugo en Universitario, Sport Boys, Sporting Cristal, Cienciano y actualmente en Alianza lima y así como Alexis Ubillús también llego a participar en la selección peruana de fútbol. Hacia el año 97 la gran mayoría de esta categoría paso a formar parte del plantel de Primera división de Liga de San Isidro.
Ya en el 98 sale la categoría 83 mas conocida como la “Sub-campeona”, pues quedo en Segundo lugar en todos los campeonatos en los que participo, tales como los campeonatos zonales, ínter zonales, provinciales y departamentales, hacia el año 2002 la gran parte de los integrantes de esta categoría junto a los de la categoría 80 hicieron la renovación natural de los primeros integrantes de la plantilla de la institución.
Entre el 2002 y el 2003 aparece la categoría 87, la cual participo activamente en distintos campeonatos logrando un éxito relativo en todas sus presentaciones; con el tiempo fueron madurando y hoy en día la gran mayoría son integrantes de la plantilla del equipo de la Liga.
En los años siguientes el club tuvo altas y bajas, pero siempre se mantuvo en la Primera División de la liga de San Isidro; por mas que a la liga fueron ingresando instituciones de gran prestigio y poder económico como, Regatas Lima, Circolo Sportivo Italiano, Club Árabe Palestino, Lima Cricket, Real Club entre otros los cuales levantaron el nivel de competencia de la liga, esto es un factor que demuestra el valor del club al mantenerse tantos años.
El club se forma para que la juventud de la urbanización tenga un lugar donde desarrollar su deporte favorito a nivel competitivo, la practica del deporte es un punto para el desarrollo de la persona, por eso la idea del club es formar personas de gran valor moral y que sepan de los sacrificios y del trabajo en grupo para poder llegar a sus metas.
Este trabajo ha ido dando sus frutos a pesar de no contar con grandes fondos de financiación, ya que la institución subsiste del apoyo económico de los propios jugadores, los propios miembros y con el apoyo de algunos vecinos; que creen como nosotros que el deporte es fundamental en la vida de toda persona.
Pero mas que una institución o un Club es una gran familia que se apoya para salir adelante, pues nos unen fuertes lazos de amistad, que se han ido fortaleciendo con los años de convivencia y de trabajo en equipo; donde el respeto, la solidaridad, la honestidad y la perseverancia son nuestros principios para el éxito.
Ya son 20 de años de vida institucional, desde el Deportivo Las Magnolias a la fecha, brindando la oportunidad de practicar el deporte mas libre y bello del mundo, enseñando lo que es el trabajo, la dedicación, el sacrificio, la solidaridad y la perseverancia, que todo es posible cuando se intenta y se tiene la voluntad de hacerlo, que la amistad es algo muy preciado e importante, que en la vida debe de existir un equilibrio y un orden. Más que un club es un sentimiento que crece cada día más y ha pasado a ser parte de las vidas de quienes integran esta gran institución.